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生物安全防护水平为一级的实验室适用于操作在通常情况下不会引起人类或者动物疾病的微生物。一级生物安全实验室的操作、安全设备和实验设施的设计和建设仅适用于进行基础的教学和研究，处理危害等级1的微生物。BSL-1是生物安全防护的基本水平，依靠标准的微生物操作来保证安全，缺少特殊的一级防护屏障或二级防护屏障。一般来说，一级生物安全实验室仅能从事没有感染性的操作，不能满足食品微生物检测实验室的工作需要。
一级生物安全实验室需满足如下设施和设备的要求：实验室的门应有可视窗并可锁闭，门锁及门的开启方向应不妨碍室内人员逃生。应设洗手池，宜设置在靠近实验室的出口处：实验室门口处应设存衣或挂衣装置，可将个人服装与实验室工作服分开放置。实验室的墙、天花板和地面应易清洁、不渗水、耐化学品和消毒灭菌剂的腐蚀。地面应平整、防滑，不应铺设地毯。实验室台柜和座椅等应稳固，边角应圆滑。实验室台柜等和其摆放应便于清洁，实验台面应防水、耐腐蚀、耐热和坚固。实验室应有足够的空间和台柜等摆放实验室设备和物品。应根据工作性质和流程合理，放实验室设备、台柜、物品等，避免相互干扰、交叉污染，并应不妨碍逃生和急救。实验室可以利用自然通风。如果采用机械通风，应避免交叉污染。如果有可开启的窗户，应安装可防蚊虫的纱窗。实验室内应避免不必要的反光和强光。若操作刺激或腐蚀性物质，应在30 m内设洗眼装置，必要时应设紧急喷淋装置。若操做有毒、刺激性、放射性挥发物质，应在风险评估的基础上，配备适当的负压排风柜。若使用高毒性、放射性等物质，应配备相应的安全设施、设备和个体防护装备，应符合国家、地方的相关规定和要求。若使用高压气体和可燃气体，应有安全措施，应符合国家、地方的相应规定和要求。应设应急照明装置。应有足够的电力供应。应有足够的固定电源插座，避免多台设备使用共同的电源插座。应有可靠的接地系统，应在关键节点安装漏电保护装置或监测报警装置。供水和排水管道系统应不渗漏，下水应有防回流设计。应配备适用的应急器材，如消防器材、意外事故处理器材、急救器材等。应配备适用的通讯设备。必要时，应配适当的消毒灭菌设备。
二、二级生物安全实验室
生物安全防护水平为二级的实验室适用于操作能够引起人类或者动物疾病，但一般情况下对人、动物或者环境不构成严重危害，传播风险有限，实验室感染后很少引起严重疾病，并且具备有效治疗和预防措施的微生物。二级生物安全实验室的操作、安全设备和实验设施的设计和建设适用于临床、诊断、教学，处理危害等级II的微生物。
BSL-2实验室的危险主要是意外的经皮肤或黏膜接触或摄入生物危险物质，需使用生物安全柜进行防护。BSL-2实验室有比较齐全的一级屏障，例如个人防护装备，也有废弃物消毒设施等二级屏障来保正安全。对于广大食品微生物检测实验室，一般都要开展沙门氏菌、金黄色葡萄球菌等危害等级II的致病微生物的检测工作，需要达到二级生物安全实验室的防护水平。
二级生物安全实验室的设施和设备要求除要达到一级生物安全实验室的要求外，还要满足：实验室主入口的门、放置生物安全柜实验间的门应可自动关闭；实验室主入口的门应有进入控制措施。实验室工作区域外应有存放备用物品的条件。应在实验室工作区配备洗眼装置。应在实验室或其所在的建筑内配备高压蒸汽灭菌器或其他适当的消毒灭菌设备，所配备的消毒灭菌设备应以风险评估为依据。应在操作病原微生物样本的实验间内配备生物安全柜。应按产品的设计要求安装和使用生物安全柜。如果生物安全柜的排风在室内循环，室内应具备通风换气的条件；如果使用需要管道排风的生物安全柜，应通过独立于建筑物其他公共供通风系统的管道排出。应有可靠的电力供应。必要时，重要设备(如：培养箱、生物安全柜、冰箱等)应配置备用电源。
